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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210181232.6 (22)申请日 2022.02.25 (71)申请人 西安邮电大 学 地址 710121 陕西省西安市雁塔区长安 南 路563号 (72)发明人 陈皓 陈坤钧 刘洋  (51)Int.Cl. G06T 7/00(2017.01) G06V 10/80(2022.01) G06V 10/771(2022.01) G06V 10/762(2022.01) G06V 10/764(2022.01) G06V 10/766(2022.01) G06K 9/62(2022.01) G16H 50/30(2018.01) G06N 20/20(2019.01)G06N 5/00(2006.01) (54)发明名称 基于核磁共振影像的两阶段脑胶质瘤患者 生存期预测方法 (57)摘要 本发明公开了一种基于核磁共振影像数据, 通过两阶段计算机制来实现高阶脑胶质瘤患者 预后生存期预测的方法, 属于计算机视觉和模式 识别领域。 步骤为: 1.构建肿瘤子区域与核磁共 振影像序列之间的匹配组合 关系; 2.通过特征聚 类计算进行特征约减并得到压缩特征向量; 3.借 助压缩特征对64种序列组合进行评估; 4.构建两 阶段预测模型, 首先对患者进行生存阶段二分 类, 然后针对性地采用子预测模 型进行预后生存 天数预测。 本发明通过对影像序列的组合优化, 降低了所使用的特征集规模; 所提出的特征压缩 方法提高了评估效率与准确率; 通过所构建的两 阶段计算模 型, 针对性地处理不同生存阶段的病 例, 克服了单一模型的局限性, 同时提高了整体 的预测准确性。 权利要求书3页 说明书6页 附图3页 CN 114463325 A 2022.05.10 CN 114463325 A 1.一种基于多序列核磁共振影像(Magnetic  Resonance  Imaging, MRI)数据, 通过所设 计的两阶段计算机制实现对高阶脑胶质瘤(High  Grade Glioma, HGG)患者进行预后生存期 预测的方法, 所述方法包括以下步骤: 步骤1: 数据准备, 具体为: 每个患者 的MRI数据包含4种序列类型(T1, T1ce, T2和 Flair)的图像, 图像主要包括肿 瘤病灶的3个子区域, 分别为: 坏死非增强核心区(NET)、 瘤周水肿区(ED)、 增强核心区(ET); 步骤2: 构建肿瘤子区域与MR影 像序列之间的匹配关系, 具体为: 建立“肿瘤子区域 ‑单一影像序列”匹配关系, 基于此构建64种组合关系, 可表示 为: E={Ci|i=1, 2, ..., 64} 其中, Ci表示一种组合关系, E表示64种组合关系的集 合; 步骤3: 数据集构建, 具体为: 步骤3.1: 提取肿瘤几何特征, 利用OpenCV计算70个描述肿瘤几何特性的特征, 包含体 积、 表面积、 长短轴长度、 三维坐标和球形率 等特征, 构成肿瘤几何特 征集Fgeometric; 步骤3.2: 提取影 像组学特征(一阶特 征和纹理特征), 具体为: 输入组合关系Ci, 对Ci包含的序列图像进行影像组学特征提取, 分别提取影像 组学特征 680个, 合并NET、 ED、 ET三个子区域的特 征 和 形成影像组学特征集 其中, 为2040(680 *3)维, i表示对应第i种组合关系; 步骤3.3: 特征融合形成特征集合, 首先将临床数据中的年龄作为补充特征, 将影像组 学特征、 肿瘤几何特 征进行融合, 患者特 征数据集 可表示为: 其中Fgeometric表示70维Opencv提取的肿瘤几何特征, Fage表示年龄特征, 包含2111 维特征; 步骤3.4: 输出组合关系 Ci下的患者特征数据集 其中包含n例患者和2111维特征, 重复步骤3.2、 3.3; 步骤4: 肿瘤子区域与MR影 像序列之间的对应关系优化, 具体为: 步骤4.1: 通过基于 K‑means聚类的特征压缩进行特征约减, 输入组合 关系Ci对应的患者 特征数据集 将 划分为2111个特征向量Ωl作为聚类对象, 其中特征向量由n例患 者的特征值组成, 可表示 为: 其中, 表示第m个患者的第l个特 征的特征值, n表示患者数; 步骤4.1.1: 从{Ωl}中随机选择K个特征作为初始聚类中心集 合, 可表达为: {Ψj|j=1, 2, . .., K} 其中, K表示聚类后可取得最大轮廓系数所需要的初始聚类中心数目, 可通过重复步骤 4.1计算不同K值下的轮廓系数 得到; 步骤4.1.2: 将特征集{Ωl}中的每个特征进行归属划分, 即按照欧氏距 离将每个特征划 分到与其余子类中心 中距离最小的子类中, 距 离D通过欧式距 离进行计权 利 要 求 书 1/3 页 2 CN 114463325 A 2算, 即 D(Ωl, Ψj)=||Ωl‑Ψj|| 步骤4.1.3: 更新当前簇类结构, 具体为对子类clusterj使用如下式子计算新的子类中 心Ψj: 其中|subclassj|为子类clusterj中的特征个数, 为子类clusterj中第h、 第t次序的 的特征向量, n 为患者总数; 步骤4.1.4: 重复步骤4.1.2、 4.1.3, 直到 子类中心{Ψj|j=1, 2, . .., K}不再发生变化; 步骤4.1.5: 保存最终子类中心{Ψj|j=1, 2, ..., K}, 最终聚类 结果为一个 K维压缩特征 向量; 步骤4.2重复步骤4.1, 直到i =64, 输出压缩特 征向量集合, 可表示 为: CF={cfi|i=1, 2, ..., 64} 其中cfi表示包含K个子类中心的压缩特 征向量, CF表示压缩特 征向量集合; 步骤4.3: 通过压缩特 征向量集合CF进行优化评估, 具体为: 步骤4.3.1: 训练生存阶段二分类模型, 具体为: 此步骤的二分类模型采用SVC(Supp ort Vector Classification)算法, 参数设置为核 函数为Linear, 惩罚系数=1.0, 最大迭代次数=10 00; 步骤4.3.2: 生存阶段分类, 将K维压缩特征 向量cfi输入二分类器, 进行长期(生存期> 365天)和短期(生存期<3 65天)两种阶段的分类 计算; 步骤4.3.3: 分类效果评估, 保存短期和长期生存阶段分类的准确率ac curacyi; 步骤4.3.4: 重复步骤4.3.2、 4.3.3, 直至i =64; 步骤4.3.5: 根据64组分类效果评估的结果, 得到 具有最高准确率的组合关系Cbest, 即肿 瘤子区域与MR影像序列之间的最佳对应关系为: NET ‑Flair、 ED ‑T1ce、 ET‑T2, 过程可表示 为: argmax(ac curacyi|i=1, 2, ..., 64)=Cbest 其中函数argmax()表示准确率 的最大值自变量点集, 即最佳组合关系集, Cbest表示最 佳组合关系; 步骤5: 基于 两阶段计算的生存期预测, 具体为: 步骤5.1: 数据准备, 具体为: 步骤5.1.1: 训练数据, 将组合关系Cbest对应的压缩特征向量cfbest和患者特征数据集进 行合并, 得到特 征集Ftrain, 即用2111+K维特征向量训练预测模型; 步骤5.1.2: 待测数据, 首先, 基于组合关系Cbest, 一个待测患者的MRI数据通过步骤3得 到特征数据集, 然后, 通过步骤4.1得到一个K维压缩特征向量cf, 最后, 合并特征数据集和 压缩特征向量cf得到特 征集Fregression, 即使用21 11+K维特征向量预测生存期; 步骤5.2: 患者 生存阶段划分, 具体为: 步骤5.2.1: 训练生存阶段二 分类模型, 此步骤 通过K维压缩特征向量cfbest进行长期(生 存期>365天)和短期(生存期<365天)两种阶段的分类计算, 二分类模型采用SVC(Support  权 利 要 求 书 2/3 页 3 CN 114463325 A 3

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